Esta nueva historia comienza mientras Elizabeth se recupera del disparo que sufrió en el final de la primera temporada y lo que provoca que los Jennings vuelven a sus actividades cotidianas. La mayor parte de esta nueva temporada se centra en la pareja tratando de robar información sobre tecnología secreta, ya sea tratando de adquirir planos submarinos nucleares, tratando de rescatar a un científico soviético, o apoderarse de un nuevo sistema para computadoras que se conoce con el nombre de Echo. A pesar de sus intentos por cumplir sus misiones con el mayor grado de éxito, algunas terminan con terribles resultados y perdidas importantes para los agentes.